Une fondation médiévale sous l’influence des seigneurs de Sully
L’historien du XVIIe siècle Gaspard Thaumas de la Thaumassière estime que l’église, qui servait de chapelle au château, a été érigée avant 1120 par la famille de Sully, alors propriétaire de la châtellenie des Aix. Le saint auquel l’église est dédiée, saint Ythier, évêque de Nevers au VIIe siècle, est aussi le patron d’autres fondations de cette famille, telles que la collégiale Saint-Ythier à Sully-sur-Loire.
En 1120, l’église est transformée en collégiale avec l’établissement d’un chapitre composé de six chanoines réguliers de saint Augustin, regroupés avec ceux de la cathédrale de Bourges par l’archevêque Vulgrin. Environ trente ans plus tard, une reconstruction de l’église est entreprise. En 1213, le nombre de chanoines passe à douze. En 1403, Jean de Berry récupère une partie du bras et du chef de saint Ythier à Nogent-sur-Vernisson et offre ces reliques à la collégiale.
Une architecture préservée au fil des siècles
En 1678, l’église devient paroissiale sous le vocable de saint Germain, en remplacement de l’église paroissiale Saint-Germain à Valentigny, détruite par le feu. À cette occasion, une partie de la tour de la croisée est démolie et remplacée par un clocher en bois, tandis que le bras nord du transept est partiellement reconstruit et son absidiole est supprimée. La façade occidentale est reconstruite en 1858 et des travaux de restauration continuent entre 1875 et 1890, incluant la construction d’une sacristie à l’angle de la nef et du bras sud du transept.
Le plan de l’église, qualifié de plan bénédictin par Eugène Lefèvre-Pontalis, se retrouve dans d’autres églises au-delà de celles appartenant à l’ordre de Saint-Benoît. Orientée vers l’est, l’église se compose d’une grande nef rectangulaire unique, d’un transept qui, par le passé, était accompagné au nord et au sud de deux absidioles, d’une tour clocher située à la croisée du transept, et d’un long chœur terminé par une abside, avec deux absidioles symétriques de chaque côté. Ses dimensions sont d’environ 43 mètres de la façade au chevet, 26,5 mètres entre les pignons du transept, et la nef mesure 20 mètres de long sur 13,5 mètres de large à l’extérieur.
